NGS解析法のセミナーと草刈り

9月13日に今年最後の桑園の草刈りを行いました。

こちらは下の桑園「剣持」です。before・・・

after・・・キレイになりました。

こちらは上の桑園「しんいちのせ」。エリ蚕の食草のヒマも植わっています。

・・・キレイになりました。雑草の草丈は長いのですが、量はそうでもないので1時間半ほどで終わりました。3月で退官される川崎先生が「僕の最後の草刈り」と呟いていました。そんなことありません。草刈り、いつでも歓迎します。

 

翌14日は学振PDの庄司さんに次世代シーケンサーのデータ解析に関するセミナーをしていただきました。

FASTQ形式のデータをリファレンス配列を用いてマッピングし、得られたBED形式のデータをRを使って処理します。目的に応じてRPKMやDEGsに正規化し解析をするという流れです。

実際のLINUXの画面などを示して分かりやすく説明して頂きました。

庄司さん、有難う御座いました。

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